故事發(fā)生的地點(diǎn)是在每千年回歸一次的彗星造訪過(guò)一個(gè)月之前，日本飛驒市的鄉(xiāng)下小町糸守町。在這里女高中生三葉每天都過(guò)著憂郁的生活，而她煩惱的不光有擔(dān)任町長(zhǎng)的父親所舉行的選舉運(yùn)動(dòng)，還有家傳神社的古老習(xí)俗。在這個(gè)小小的町，周圍都只是些愛(ài)瞎操心的老人。為此三葉對(duì)于大都市充滿了憧憬。

然而某一天，自己做了一個(gè)變成男孩子的夢(mèng)。這里有著陌生的房間、陌生的朋友。而眼前出現(xiàn)的則是東京的街道。三葉雖然感到困惑，但是能夠來(lái)到朝思暮想的都市生活，讓她覺(jué)得神清氣爽。另一方面在東京生活的男高中生立花瀧也做了個(gè)奇怪的夢(mèng)，他在一個(gè)從未去過(guò)的深山小町中，變成了女高中生。兩人就這樣在夢(mèng)中邂逅了彼此。